这篇研究深入探讨了胰腺癌（PDAC）发展的早期阶段，特别关注了p53基因失活和KRAS信号通路在胰腺上皮细胞中的作用。文章识别了一种独特的祖细胞样状态，该状态在癌症发生前就同时激活了促肿瘤和抑癌程序，并与胰腺微环境的重塑紧密相关。通过小鼠模型和人类组织的单细胞转录组学和空间分析，研究人员揭示了p53...

这篇文章介绍了一种名为 CellFM 的新型大规模基础模型，其专门用于分析单细胞转录组数据。作者们通过汇编 1亿个人体细胞 的多样化数据集来训练 CellFM，并采用了一种改进的 RetNet架构 来确保高效的训练和性能。该模型包含 8亿个参数，在细胞注释、基因功能预测和基因相互作用分析等多个单细胞...

这篇文章主要介绍亚洲免疫多样性图谱（AIDA），这是一项对来自五个亚洲国家的健康捐献者的循环免疫细胞进行的多国单细胞参考研究。研究强调了自我报告的种族、遗传祖先、性别和年龄等因素如何显著影响免疫细胞的分子和细胞特性。它还揭示了不同人群中细胞集群的丰度差异，并识别了与疾病相关基因座的特定人群功能变异（...

这篇研究利用 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和 多重成像技术 (CODEX) 详细描绘了人类骨髓的细胞组成和空间结构。研究揭示了 间充质基质细胞 (MSCs) 具有转录和功能上的异质性，并发现了 造血干/祖细胞 (HSPCs) 主要定位于脂肪细胞周围的区域。此外，文章还展示了利用所建立的...

文章介绍了一种名为 GeneAgent 的新型 AI 语言代理，专为 基因集分析 设计。GeneAgent 旨在通过 自主与生物数据库交互以验证其输出 的方式，来 减少大型语言模型 (LLMs) 在生成基因功能描述时可能出现的“幻觉” 或事实错误。研究表明，与 GPT-4 等现有 LLMs 相比，G...

这篇文章概述了一项综合性研究，该研究利用空间蛋白质组学和转录组学技术，揭示了卵巢交界性肿瘤向侵袭性低级别浆液性癌发展的分子机制。研究人员整合了细胞类型分辨的深度视觉蛋白质组学和空间转录组学数据，以识别和验证疾病进展的关键驱动因素，并提出了针对这种化疗耐药性疾病的潜在联合治疗方案。特别指出，微乳头状交...

CELLFORGE是一种利用多智能体框架来自动设计和优化虚拟细胞计算模型的系统。该系统通过任务分析、方法设计和实验执行三个核心模块，将原始单细胞多组学数据和研究目标转化为优化的模型架构和可执行代码。任务分析模块负责数据特征提取和文献检索，方法设计模块中的专家代理通过协作讨论开发建模策略，实验执行模块...

这篇综述文章深入探讨了肿瘤血管生成与肿瘤免疫之间的复杂相互作用，重点关注它们如何影响癌症进展和免疫疗法结果。文章解释了异常肿瘤血管如何通过限制免疫细胞渗透并营造免疫抑制性微环境来阻碍有效的抗肿瘤免疫反应。研究人员还阐述了通过血管正常化改善抗肿瘤免疫力的方法，以及血管正常化与免疫检查点阻断（ICB）疗...

这篇研究论文详细描绘了人类大脑皮层在单细胞分辨率下的空间转录组图谱。作者们通过结合单核RNA测序和亚细胞水平的空间转录组测序技术，绘制了14个人类皮层区域的综合细胞图谱。该图谱揭示了神经细胞类型独特的表达模式和空间排列，特别关注了谷氨酸能神经元和GABA能神经元的组织。此外，研究还探索了细胞间的相互...

这篇研究文章深入探讨了蚂蚁社会进化背后的遗传机制，主要通过对163种蚂蚁基因组的广泛比较分析。文章阐述了蚂蚁等级分化的群落如何起源并成为陆地生态系统的主导力量，其成功归因于类似于多细胞生物体体细胞的劳动分工。研究团队通过全球蚂蚁基因组联盟（GAGA）收集高质量基因组数据，揭示了染色体重新排列与物种多...